Merenkurkun maailmanperintöhankkeella on ollut ohjausryhmä v. 2000-2006. Positiivisen maailmanperintöpäätöksen jälkeen ympäristöministeriö päätti tammikuussa 2007 että, Metsähallituksen luontopalvelut koordinoi Merenkurkun maailmanperinnön hallintoa ja kutsuvat koolle maailmanperintöneuvottelukunnan. Neuvottelukunnan ensimmäinen kokous oli 13.2.2007.

Laaja maailmanperintöalue kattaa 5 kuntaa; Mustasaari, Vaasa, Vöyri-Maksamaa, Maalahti ja Korsnäs. Maailmanperintöalue on 194 400 ha ja suurin osa on yksityisomistuksessa (94% maasta ja 57,5% vesistä).